L'Aéroport National de Milos (MLO) se situe à moins de 5 km du port Adamas, au sud-est de la Baie de Milos, la «mer intérieure» de l'île. C'est un tout petit aéroport, qui n'est desservi que depuis Athènes et, en haute saison, depuis Thessalonique. Sa piste est longue de 1030 m seulement.
Trois compagnies desservent Milos: Olympic Air et Sky Express depuis Athènes, Astra Airlines depuis Thessalonique.
